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如何使用NCBI工具

2023-07-05 10:54:38    出處:互聯網


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1. NCBI工具是生物信息學研究的重要工具,可以用來查找和分析生物序列信息。NCBI提供的工具包括BLAST、GenBank、Entrez等。其中,BLAST是最為著名的工具之一,可以在數據庫中查找相似序列。這篇文章將簡單介紹如何使用BLAST來搜索和分析生物序列信息。2. 首先,訪問NCBI的網站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov),在頂部的搜索欄中輸入想要查詢的關鍵詞。這樣可以找到大量的相關文獻、序列等信息。如果要搜索特定的生物序列,可以在“BLAST”標簽下選擇相應的工具,比如“BLASTn”用于核酸搜索,而“BLASTp”適用于蛋白質搜索。3. 接下來,上傳或輸入查詢序列。上傳文件可以是FASTA格式,或是直接將序列復制粘貼至搜索欄中。BLAST會像搜索引擎一樣,在數據庫中查找與查詢序列相似度最高的序列。搜索結果可以按多個參數進行篩選,如基因型、物種、文章等。4. BLAST的結果以表格形式顯示,表格中包含了每個匹配的信息,如匹配度、E值、比對長度等。通過對結果的篩選與解讀,可以獲得目的序列的相似序列組。在得到了相似序列后,可以進一步對它們進行比對和分析。5. 總結:NCBI工具旨在為生物信息學研究人員提供全面的生物信息資源和工具。BLAST作為其中最重要的工具之一,可以幫助我們搜索和分析生物序列的相似信息,并進一步深入了解其結構與功能。

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